Chuyến bay 826 được lái bởi các phi công có kinh nghiệm. Cơ trưởng đã có khoảng 15.000 giờ bay, trong đó có 1.100 giờ trên Boeing 747. Cơ phó có khoảng 10.000 giờ, trong đó có 1.500 giờ trên Boeing 747 và kỹ sư bay có khoảng 3.500 giờ bay, trong đó có 850 giờ trên Boeing 747. Phi hành đoàn có thâm niên từ 8 đến 34 năm.[4]

Chuyến bay 826 rời sân bay Narita của Tokyo vào ngày 28 tháng 12 năm 1997, lúc 20:30 giờ địa phương. Nó đạt độ cao hành trình là 31.000 foot (9.400 m) chỉ chưa đầy nửa giờ sau đó. Chuyến bay ban đầu được lên kế hoạch bay ở độ cao 35.000 foot (11.000 m), nhưng kiểm soát không lưu (ATC) chỉ cho phép bay ở độ cao thấp hơn do không lưu. Cơ trưởng đã chọn tuyến đường được phép duy nhất vào thời điểm không có giông bão hoặc giông bão nghiêm trọng.[5]

Ở độ cao hành trình, ban đầu chuyến bay gặp sóng gió đủ lớn để cơ trưởng bật biển báo "thắt dây an toàn".[6] Mười lăm phút sau, nhiễu loạn lắng xuống và biển báo thắt dây an toàn đã tắt. Vào thời điểm đó, cơ trưởng đã thông báo với hành khách rằng vẫn có khả năng xảy ra nhiễu loạn và nên thắt dây an toàn khi ngồi. Một tiếp viên hàng không cũng đưa ra thông báo tương tự bằng tiếng Nhật.

Khoảng một giờ sau, sau khi điều kiện yên tĩnh, "biển báo thắt dây an toàn" lại xuất hiện mà không có bất kỳ thông báo nào. Sau khoảng hai phút nhiễu động không mạnh lắm, đột nhiên chiếc 747 giảm nhẹ rồi vọt lên rồi lao xuống với tốc độ nhanh đến mức một người theo đuổi đang bám vào một mặt bàn cố định thấy mình đang bị treo ngược và đang giữ mặt bàn bằng tay. chân trong không khí. Sau đó, máy bay nâng độ cao và leo dốc trước khi rơi mạnh trở lại, điều này xảy ra khi cánh phải hạ xuống mạnh. Sau một lần leo dốc vừa phải, chuyến bay trở lại bình thường.

Sau vụ việc, một phụ nữ Nhật Bản không thắt dây an toàn được tìm thấy nằm bất tỉnh và chảy nhiều máu trên lối đi. Bất chấp những nỗ lực hồi sức nhanh chóng của các tiếp viên hàng không bị thương và một bác sĩ hành khách, cô ấy đã sớm được tuyên bố là đã chết.

Mười lăm hành khách và ba tiếp viên hàng không bị gãy xương sống và cổ. 87 hành khách khác bị bầm tím, bong gân và các vết thương nhẹ khác. Trong khi sân bay Henderson trên đảo san hô Midway là sân bay gần nhất, cơ trưởng đã chọn quay lại Tokyo sau khi đánh giá máy bay vẫn có thể bay được và Tokyo có các cơ sở y tế được đánh giá là tốt hơn để xử lý các vết thương.

Ba tiếng sau, máy bay hạ cánh an toàn xuống sân bay Narita.